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期刊名称:药物分析杂志
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基于网络药理学的半边莲-半枝莲药对抗胃癌相关作用机制研究
分类号:
出版年·卷·期(页码):2020,40 (7):1243-1253
DOI:
10.16155/j.0254-1793.2017.01.01
-----摘要:-------------------------------------------------------------------------------------------
目的:基于网络药理学方法探讨半边莲-半枝莲药对抗胃癌的相关作用机制。方法:利用TCMSP数据库获得半边莲和半枝莲的化学成分及对应作用靶点基因,检索Gene Cards和OMIM数据库获得疾病胃癌相关靶点基因,然后取两者的交集,得到半边莲-半枝莲药对作用于胃癌的预测靶基因。利用Cytoscape 3.7.1软件构建半边莲-半枝莲药对化合物-作用靶点-疾病三者相互关系网络,采用STRING数据库对半边莲-半枝莲药对作用于胃癌的预测靶基因进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape 3.7.1软件的插件Cytohubba筛选出关键基因(hub基因),并利用ONCOMINE数据库分析关键基因在胃癌中的表达情况。利用在线工具DAVID进行GO功能富集分析和利用Cytoscape 3.7.1软件的Clue GO插件进行KEGG信号通路富集分析。结果:共筛选出半边莲-半枝莲药对作用于胃癌的预测靶基因81个,关键靶基因(hub基因)6个,这些关键基因在ONCOMINE数据库的胃癌样本和正常样本中存在显著的表达差异。GO功能富集分析主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、凋亡过程的负调控等生物过程;KEGG通路富集分析主要涉及肿瘤通路、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、p53信号通路等信号通路。结论:本研究初步预测了半边莲-半枝莲药对治疗胃癌的主要作用靶点及多靶点、协同作用、整体调节的作用机制,可为后续进一步深入研究其作用机制提供有益参考。
-----英文摘要:---------------------------------------------------------------------------------------
-----参考文献:---------------------------------------------------------------------------------------
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